リジェクト対応方法:3.5 Small and large App icons should be similar, so as to not to cause confusion

アプリの大、小のアイコンは混乱が生じないために同様であるべきです

iPhoneにも解像度の違いがあるので、アイコンも複数サイズを設定できます。
そこで、別々のデザインのアイコンを設定してはいけませんよということですね。
もちろんアプリ側とストア側のアイコンが違ってもダメです。